La sezione canoa della Canottieri Ticino nasce nel 1965 quando per la prima volta in società viene acquistata una canoa. Dal 1965 ad oggi la Canottieri Ticino è diventata, grazie ai suoi atleti, un punto di riferimento per tutta la canoa italiana: il duro lavoro di atleti ed allenatori ha fatto della Canottieri una fucina di talenti che negli anni hanno portato il movimento italiano in cima al mondo. Dopo i primi titoli nella canoa fluviale è nel 1980 che la Canottieri raggiunge il suo primo titolo italiano nella velocità, specialità che da lì in poi darà grandi soddisfazioni alla società, in particolare sotto la guida di Antonio Mortara. Nel 1997 e nel 1998 Luca Negri conquisterà per due anni consecutivi il titolo di Campione Mondiale, a cui aggiungerà nel 1997 quello di Campione Europeo; nel 2000 Jacopo Majocchi prenderà parte alle Olimpiadi di Sidney concludendo ottavo la finale del K1 1000 metri. Insieme a loro tanti altri atleti faranno della Canottieri una delle società più forti nel panorama nazionale iniziando una tradizione che prosegue ancora oggi: il 2016 è stato infatti per la sezione canoa un anno indimenticabile culminato con il sesto posto ai Giochi Olimpici di Rio de Janeiro conquistato da Manfredi Rizza, arrivato alle Olimpiadi al termine di una stagione straordinaria che l’ha visto anche vincere la medaglia d’oro individuale nella seconda prova di Coppa del Mondo ed un oro ed un argento nelle gare del K4 insieme ai compagni di squadra Michele Bertolini e Riccardo Cecchini. Con il titolo di Campione Europeo Under 23 e di Campione del Mondo Universitario anche Michele Bertolini ha scritto il suo nome nella storia della canoa italiana così come ha fatto Francesca Genzo, medaglia d’argento ai Mondiali Universitari. Insieme ai tanti campioni, si allena alla Canottieri una squadra solida e giovane, un esempio per i tanti bambini che sempre più spesso si approcciano allo sport della canoa per imparare a vivere il fiume.